大悲禅院玄奘法师纪念堂位于大悲殿东侧，与西侧的弘一法师纪念堂正好对称，是为供奉唐代高僧玄奘大师的顶骨而设置的专室。纪念堂庄严大方，清雅肃穆。进门迎面供奉着高约二米的玄奘法师绣像，供桌上高约一点二米的莲座金色塔，象征以往供奉玄奘法师灵骨的史实和因缘。堂内还展示着“玄奘法师生平业迹”、“玄奘法师西行求法路线图”、“玄奘法师译经年代表”,以及关于玄奘法师顶骨等文字说明资料。同时陈列由玄奘法师主译的部分经论与典籍，珍存许多有关玄奘法师生平事略及其墓塔、灵骨等真实照片。不仅是礼拜玄奘法师的庄严佛堂，而且是了解法师生平、学习法师精神、缅怀法师业迹的形象课堂。